♻️ refactor(cook-it-through): move workflow engine into skill

SKILLS.md

@@ -69,6 +69,21 @@ skills = [“commit-message”]
 agents_home = “~/.claude”   # 或 ~/.agents
 ```
 
+从本次安装集合中排除指定 skills；`mode = "all"` 和 `mode = "list"` 均可使用：
+
+```toml
+[install_skills]
+mode = "all"
+exclude = ["skill-a", "skill-b"]
+agents_home = "~/.agents"
+```
+
+`exclude` 只跳过本次安装或更新，不会删除目标目录中已经存在的同名 skill。空数组
+`exclude = []` 等同于不排除。
+
+同一配置启用 `[sync_rules]` 时，`cook-it-through` 是规则入口的必需依赖：`mode = "list"`
+必须显式列出，且两种 mode 都不得通过 `exclude` 排除。无效组合会在任何同步写入前失败。
+
 `[install_skills]` 默认会先把已存在的 skill 目录重命名为 `*.bak.<timestamp>`，再复制新版本，便于手动回退。若不需要备份：
 
 ```toml